烟气净化系统采用“SNCR+半干式脱酸（机械旋转喷雾）+干法脱酸（消石灰喷射）+活性炭喷射+袋式除尘器”工艺。烟气净化系统与焚烧炉对应配置，共4套。吸收剂用消石灰，设置2套石灰乳制备系统。烟气净化系统SO2的脱除率大于90%，HCl的脱除率大于99%，烟尘的净化率大于99.9%。每一条焚烧线单独配备一条烟气净化处理线，包括：脱酸反应塔、石灰浆制备与喷射系统、消石灰粉喷射系统、活性炭喷射系统、布袋除尘系统、引风系统、飞灰输送系统、SNCR系统等，其中石灰浆制备与喷射系统、消石灰粉喷射系统、活性炭喷射系统、飞灰输送系统。SNCR系统等为全厂烟气处理线所公用。垃圾焚烧产生的烟气，经过“SNCR+半干法脱酸+干石灰喷射（干法脱酸）+活性炭吸附+布袋除尘”烟气净化系统的处理，达到欧盟2000/76/EC标准的要求，经烟囱排放。本项目设置4条烟气净化处理线，辅助系统按4条处理线设置。